Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4A3P38919 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms