Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FLT4P35916 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FLT4P35916 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FLT4P35916 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLT4P35916 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLT4P35916 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLT4P35916 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLT4P35916 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLT4P35916 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLT4P35916 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FLT4P35916 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FLT4P35916 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FLT4P35916 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FLT4P35916 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FLT4P35916 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FLT4P35916 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FLT4P35916 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FLT4P35916 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FLT4P35916 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FLT4P35916 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FLT4P35916 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FLT4P35916 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FLT4P35916 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FLT4P35916 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FLT4P35916 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FLT4P35916 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FLT4P35916 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FLT4P35916 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FLT4P35916 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FLT4P35916 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FLT4P35916 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FLT4P35916 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FLT4P35916 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FLT4P35916 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FLT4P35916 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms