Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COPB2P35606 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPB2P35606 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPB2P35606 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPB2P35606 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPB2P35606 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COPB2P35606 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPB2P35606 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPB2P35606 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPB2P35606 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COPB2P35606 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPB2P35606 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPB2P35606 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPB2P35606 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COPB2P35606 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPB2P35606 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COPB2P35606 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPB2P35606 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPB2P35606 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPB2P35606 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPB2P35606 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPB2P35606 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPB2P35606 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPB2P35606 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPB2P35606 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COPB2P35606 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COPB2P35606 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COPB2P35606 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COPB2P35606 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COPB2P35606 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COPB2P35606 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COPB2P35606 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COPB2P35606 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COPB2P35606 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms