Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SCN4AP35499 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN4AP35499 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms