Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXA13P31271 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA13P31271 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms