Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CLIP1P30622 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLIP1P30622 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CLIP1P30622 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms