Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HMGB2P26583 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms