Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
DNMT1P26358 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
DNMT1P26358 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DNMT1P26358 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms