Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA3P26006 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ITGA3P26006 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms