Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PSMA4P25789 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMA4P25789 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms