Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDELR1P24390 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KDELR1P24390 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms