Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP1P23763 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP1P23763 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms