Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPREP23469 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPREP23469 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPREP23469 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPREP23469 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPREP23469 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPREP23469 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPREP23469 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPREP23469 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPREP23469 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPREP23469 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPREP23469 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPREP23469 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPREP23469 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPREP23469 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPREP23469 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPREP23469 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPREP23469 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPREP23469 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPREP23469 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPREP23469 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPREP23469 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPREP23469 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPREP23469 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPREP23469 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPREP23469 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPREP23469 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPREP23469 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPREP23469 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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