Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGFR4P22455 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGFR4P22455 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms