Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCL3P20749 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BCL3P20749 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BCL3P20749 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BCL3P20749 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BCL3P20749 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BCL3P20749 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
BCL3P20749 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BCL3P20749 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BCL3P20749 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCL3P20749 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCL3P20749 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCL3P20749 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCL3P20749 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCL3P20749 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCL3P20749 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCL3P20749 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BCL3P20749 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms