Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXA5P20719 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms