Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CXCL2P19875 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
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CXCL2P19875 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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CXCL2P19875 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CXCL2P19875 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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