Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCLP19338 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCLP19338 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCLP19338 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCLP19338 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NCLP19338 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCLP19338 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLP19338 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLP19338 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLP19338 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLP19338 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLP19338 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLP19338 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLP19338 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLP19338 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCLP19338 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCLP19338 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCLP19338 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCLP19338 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCLP19338 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCLP19338 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCLP19338 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCLP19338 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCLP19338 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms