Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KRT15P19012 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KRT15P19012 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KRT15P19012 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT15P19012 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT15P19012 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT15P19012 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT15P19012 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT15P19012 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT15P19012 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT15P19012 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT15P19012 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT15P19012 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT15P19012 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT15P19012 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT15P19012 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT15P19012 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT15P19012 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT15P19012 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT15P19012 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT15P19012 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT15P19012 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms