Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPN1P18031 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms