Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PFKLP17858 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PFKLP17858 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PFKLP17858 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PFKLP17858 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKLP17858 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKLP17858 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKLP17858 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKLP17858 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKLP17858 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKLP17858 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKLP17858 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PFKLP17858 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PFKLP17858 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PFKLP17858 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PFKLP17858 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PFKLP17858 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms