Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYN1P17600 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYN1P17600 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYN1P17600 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYN1P17600 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SYN1P17600 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYN1P17600 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SYN1P17600 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYN1P17600 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYN1P17600 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYN1P17600 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYN1P17600 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SYN1P17600 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SYN1P17600 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SYN1P17600 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SYN1P17600 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SYN1P17600 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SYN1P17600 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SYN1P17600 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms