Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIP12755 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIP12755 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIP12755 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIP12755 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIP12755 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIP12755 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIP12755 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIP12755 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIP12755 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIP12755 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIP12755 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SKIP12755 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIP12755 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIP12755 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIP12755 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIP12755 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIP12755 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIP12755 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIP12755 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SKIP12755 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SKIP12755 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKIP12755 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKIP12755 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKIP12755 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SKIP12755 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIP12755 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIP12755 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIP12755 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIP12755 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIP12755 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIP12755 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SKIP12755 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKIP12755 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms