Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MS4A1P11836 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MS4A1P11836 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MS4A1P11836 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MS4A1P11836 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MS4A1P11836 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MS4A1P11836 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
MS4A1P11836 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MS4A1P11836 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MS4A1P11836 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MS4A1P11836 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MS4A1P11836 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MS4A1P11836 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MS4A1P11836 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MS4A1P11836 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MS4A1P11836 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MS4A1P11836 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MS4A1P11836 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MS4A1P11836 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MS4A1P11836 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
MS4A1P11836 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
MS4A1P11836 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
MS4A1P11836 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MS4A1P11836 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms