Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARBP10826 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RARBP10826 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARBP10826 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARBP10826 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RARBP10826 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARBP10826 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARBP10826 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARBP10826 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARBP10826 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RARBP10826 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RARBP10826 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARBP10826 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARBP10826 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARBP10826 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RARBP10826 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARBP10826 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARBP10826 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARBP10826 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RARBP10826 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RARBP10826 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RARBP10826 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RARBP10826 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RARBP10826 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms