Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HKR1P10072 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HKR1P10072 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HKR1P10072 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HKR1P10072 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HKR1P10072 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HKR1P10072 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HKR1P10072 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HKR1P10072 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms