Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RD3LP0DJH9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms