Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POLR2MP0CAP2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR2MP0CAP2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR2MP0CAP2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms