Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PKHD1P08F94 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PKHD1P08F94 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PKHD1P08F94 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PKHD1P08F94 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PKHD1P08F94 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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PKHD1P08F94 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PKHD1P08F94 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PKHD1P08F94 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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