Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKMP08237 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKMP08237 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKMP08237 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFKMP08237 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFKMP08237 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFKMP08237 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFKMP08237 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFKMP08237 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFKMP08237 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFKMP08237 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKMP08237 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKMP08237 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKMP08237 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKMP08237 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKMP08237 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKMP08237 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKMP08237 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKMP08237 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFKMP08237 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFKMP08237 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFKMP08237 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFKMP08237 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFKMP08237 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms