Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJB1P08034 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB1P08034 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB1P08034 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB1P08034 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB1P08034 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB1P08034 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB1P08034 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB1P08034 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB1P08034 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB1P08034 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB1P08034 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB1P08034 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB1P08034 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB1P08034 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB1P08034 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB1P08034 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB1P08034 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB1P08034 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB1P08034 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB1P08034 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB1P08034 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB1P08034 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB1P08034 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB1P08034 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GJB1P08034 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB1P08034 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB1P08034 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GJB1P08034 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB1P08034 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB1P08034 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB1P08034 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB1P08034 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB1P08034 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GJB1P08034 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB1P08034 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB1P08034 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB1P08034 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB1P08034 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB1P08034 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB1P08034 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GJB1P08034 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GJB1P08034 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms