Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECM2O94769 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECM2O94769 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECM2O94769 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECM2O94769 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM2O94769 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM2O94769 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM2O94769 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ECM2O94769 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECM2O94769 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM2O94769 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM2O94769 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM2O94769 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM2O94769 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM2O94769 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM2O94769 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM2O94769 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECM2O94769 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECM2O94769 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECM2O94769 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms