Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPM3O75607 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPM3O75607 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPM3O75607 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPM3O75607 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPM3O75607 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NPM3O75607 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPM3O75607 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPM3O75607 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPM3O75607 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPM3O75607 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPM3O75607 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPM3O75607 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPM3O75607 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NPM3O75607 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPM3O75607 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPM3O75607 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NPM3O75607 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NPM3O75607 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 484.3 ms