Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ITGA10O75578 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ITGA10O75578 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms