Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAB11FIP3O75154 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB11FIP3O75154 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms