Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP9AO75110 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9AO75110 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms