Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMFO60524 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMFO60524 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMFO60524 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMFO60524 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMFO60524 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEMFO60524 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEMFO60524 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEMFO60524 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEMFO60524 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEMFO60524 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEMFO60524 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMFO60524 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMFO60524 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMFO60524 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMFO60524 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMFO60524 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMFO60524 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMFO60524 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEMFO60524 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEMFO60524 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEMFO60524 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEMFO60524 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEMFO60524 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEMFO60524 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEMFO60524 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms