Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MARCH6O60337 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MARCH6O60337 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms