Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KIAA0556O60303 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KIAA0556O60303 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KIAA0556O60303 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms