Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP9BO43861 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP9BO43861 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms