Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSPAN6O43657 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms