Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNQ3O43525 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNQ3O43525 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms