Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CLGNO14967 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLGNO14967 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLGNO14967 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLGNO14967 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CLGNO14967 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLGNO14967 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLGNO14967 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLGNO14967 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLGNO14967 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLGNO14967 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms