Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APAF1O14727 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
APAF1O14727 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
APAF1O14727 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
APAF1O14727 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
APAF1O14727 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
APAF1O14727 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APAF1O14727 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APAF1O14727 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APAF1O14727 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APAF1O14727 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APAF1O14727 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APAF1O14727 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APAF1O14727 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APAF1O14727 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APAF1O14727 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APAF1O14727 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
APAF1O14727 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
APAF1O14727 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APAF1O14727 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APAF1O14727 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APAF1O14727 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APAF1O14727 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APAF1O14727 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APAF1O14727 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
APAF1O14727 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
APAF1O14727 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APAF1O14727 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APAF1O14727 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APAF1O14727 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APAF1O14727 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
APAF1O14727 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APAF1O14727 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
APAF1O14727 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APAF1O14727 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
APAF1O14727 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APAF1O14727 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APAF1O14727 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APAF1O14727 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APAF1O14727 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APAF1O14727 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APAF1O14727 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APAF1O14727 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms