Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EBAG9O00559 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EBAG9O00559 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms