Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KPNA3O00505 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA3O00505 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms