Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TULP2O00295 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP2O00295 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP2O00295 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP2O00295 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP2O00295 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TULP2O00295 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP2O00295 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP2O00295 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP2O00295 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP2O00295 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP2O00295 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP2O00295 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP2O00295 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TULP2O00295 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP2O00295 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP2O00295 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP2O00295 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP2O00295 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP2O00295 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP2O00295 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP2O00295 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TULP2O00295 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TULP2O00295 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TULP2O00295 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TULP2O00295 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms