Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TNFRSF10AO00220 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TNFRSF10AO00220 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms