Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QQQ9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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J3QQQ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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J3QQQ9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QQQ9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3QQQ9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
J3QQQ9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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J3QQQ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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J3QQQ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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J3QQQ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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J3QQQ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
J3QQQ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3QQQ9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
J3QQQ9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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