Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
I3L3M4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
I3L3M4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
I3L3M4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
I3L3M4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
I3L3M4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
I3L3M4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
I3L3M4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
I3L3M4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
I3L3M4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
I3L3M4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
I3L3M4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms